U Pokemon Shoot 2, moraćete da zaštitite svoj dom od invazije Pokemona. Da biste odbili napad, moraćete da koristite pištolj. Pažljivo pogledajte ekran. Čim primetite Pokemone, moraćete da uhvatite jednog od njih u okviru svog oružja i povučete okidač. Metak koji pogodi Pokemona će ga uništiti i za to ćete dobiti određeni broj poena u igri Pokemon Shoot 2.